Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ELP3Q9H9T3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ELP3Q9H9T3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ELP3Q9H9T3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ELP3Q9H9T3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ELP3Q9H9T3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ELP3Q9H9T3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms