Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
COG4Q9H9E3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
COG4Q9H9E3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COG4Q9H9E3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COG4Q9H9E3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms