Protein–RNA interactions for Protein: Q9H790

EXO5, Exonuclease V, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXO5Q9H790 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EXO5Q9H790 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXO5Q9H790 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EXO5Q9H790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EXO5Q9H790 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms