Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC38.07■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC38.06■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
RAB3GAP2Q9H2M9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC38■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.99■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
RAB3GAP2Q9H2M9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
RAB3GAP2Q9H2M9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
RAB3GAP2Q9H2M9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
RAB3GAP2Q9H2M9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAB3GAP2Q9H2M9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
RAB3GAP2Q9H2M9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms