Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C1

LHX5, LIM/homeobox protein Lhx5, humanhuman

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX5Q9H2C1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LHX5Q9H2C1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LHX5Q9H2C1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
LHX5Q9H2C1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
LHX5Q9H2C1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LHX5Q9H2C1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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