Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms