Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0F6

SHARPIN, Sharpin, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHARPINQ9H0F6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SHARPINQ9H0F6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SHARPINQ9H0F6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SHARPINQ9H0F6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SHARPINQ9H0F6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SHARPINQ9H0F6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms