Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SLC22A4Q9H015 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC22A4Q9H015 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC22A4Q9H015 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC22A4Q9H015 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms