Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1EQ9GZS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1EQ9GZS1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR1EQ9GZS1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
POLR1EQ9GZS1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
POLR1EQ9GZS1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms