Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PDGFDQ9GZP0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDGFDQ9GZP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
PDGFDQ9GZP0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PDGFDQ9GZP0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms