Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
B3GNT4Q9C0J1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
B3GNT4Q9C0J1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
B3GNT4Q9C0J1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
B3GNT4Q9C0J1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
B3GNT4Q9C0J1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms