Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CIPCQ9C0C6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CIPCQ9C0C6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CIPCQ9C0C6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CIPCQ9C0C6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CIPCQ9C0C6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms