Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GSDMCQ9BYG8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GSDMCQ9BYG8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMCQ9BYG8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMCQ9BYG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMCQ9BYG8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151 ms