Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TIPINQ9BVW5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TIPINQ9BVW5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TIPINQ9BVW5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TIPINQ9BVW5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TIPINQ9BVW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TIPINQ9BVW5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms