Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG8

KIFC3, Kinesin-like protein KIFC3, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC3Q9BVG8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KIFC3Q9BVG8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFC3Q9BVG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KIFC3Q9BVG8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KIFC3Q9BVG8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KIFC3Q9BVG8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KIFC3Q9BVG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KIFC3Q9BVG8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KIFC3Q9BVG8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms