Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EFHD1Q9BUP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFHD1Q9BUP0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFHD1Q9BUP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFHD1Q9BUP0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFHD1Q9BUP0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms