Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NDUFAF3Q9BU61 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NDUFAF3Q9BU61 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NDUFAF3Q9BU61 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms