Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF0

C2orf88, Small membrane A-kinase anchor protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf88Q9BSF0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
C2orf88Q9BSF0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C2orf88Q9BSF0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C2orf88Q9BSF0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
C2orf88Q9BSF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
C2orf88Q9BSF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms