Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC22CQ9BRL7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22CQ9BRL7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22CQ9BRL7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms