Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 RAI14-206ENST00000504052 630 ntTSL 411.11□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-207ENST00000505185 225 ntTSL 211.11□□□□□ -0.638e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 ADSL-223ENST00000638161 668 ntTSL 510.24□□□□□ -0.778e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CCDC59-205ENST00000552377 563 ntTSL 510.15□□□□□ -0.788e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 ANKMY1-211ENST00000407275 252 ntTSL 39.63□□□□□ -0.878e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 UBE3B-208ENST00000538070 3655 ntTSL 59.4□□□□□ -0.98e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 GNAI2-211ENST00000491100 3886 ntTSL 29.36□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)9.36□□□□□ -0.918e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-212ENST00000484725 468 ntTSL 29.25□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.938e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.948e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-206ENST00000429519 1798 ntTSL 59.09□□□□□ -0.958e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RNF111-210ENST00000560216 571 ntTSL 49.06□□□□□ -0.968e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 BZW1-213ENST00000491576 492 ntTSL 28.9□□□□□ -0.988e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 HSPE1-202ENST00000409468 570 ntTSL 2 BASIC8.68□□□□□ -1.028e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 FAM13A-206ENST00000504229 625 ntTSL 48.64□□□□□ -1.031e-14■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 HBS1L-211ENST00000527507 629 ntTSL 48.61□□□□□ -1.038e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.038e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CCDC59-203ENST00000548126 984 ntTSL 28.36□□□□□ -1.078e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 HADHB-207ENST00000494615 2883 ntTSL 28.33□□□□□ -1.088e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.098e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-217ENST00000511652 470 ntTSL 38.08□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 48.07□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 48.07□□□□□ -1.128e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.138e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 POLA2-205ENST00000532391 580 ntTSL 37.85□□□□□ -1.153e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 TNRC6B-209ENST00000497559 582 ntTSL 57.82□□□□□ -1.168e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 EIF5A-203ENST00000355068 923 ntTSL 27.44□□□□□ -1.228e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-205ENST00000429335 786 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.238e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-211ENST00000475291 954 ntTSL 27.07□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 47.07□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 47.07□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 47.07□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.288e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CP-204ENST00000462336 607 ntTSL 36.86□□□□□ -1.318e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CTSB-216ENST00000530290 498 ntTSL 36.81□□□□□ -1.328e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 IPO8-207ENST00000542464 535 ntTSL 56.56□□□□□ -1.368e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 MTHFD2L-214ENST00000490698 689 ntTSL 26.51□□□□□ -1.378e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 ADSL-217ENST00000636124 280 ntTSL 56.2□□□□□ -1.428e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-208ENST00000454324 2359 ntTSL 26.1□□□□□ -1.438e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 45.99□□□□□ -1.458e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-207ENST00000449777 2207 ntTSL 25.8□□□□□ -1.488e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 NGLY1-208ENST00000461491 552 ntTSL 45.8□□□□□ -1.481e-14■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 UBR1-211ENST00000569971 721 ntTSL 45.58□□□□□ -1.528e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.568e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CP-215ENST00000497902 542 ntTSL 25.22□□□□□ -1.578e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.658e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 CCDC59-204ENST00000550589 2101 ntTSL 24.7□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.668e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.728e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.758e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 DNAJB9-202ENST00000465725 343 ntTSL 24.05□□□□□ -1.768e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.98e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RAI14-216ENST00000510386 423 ntTSL 23.04□□□□□ -1.928e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 RNF111-211ENST00000560952 2136 ntTSL 1 (best)2.9□□□□□ -1.948e-8■■■■■ 37.7
BUD13Q9BRD0 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 316.34■□□□□ 0.219e-17■■■■■ 37.5
BUD13Q9BRD0 ARHGAP45-214ENST00000591293 645 ntTSL 322.45■■□□□ 1.182e-7■■■■■ 37.5
BUD13Q9BRD0 WDR55-202ENST00000504897 2953 ntTSL 216.32■□□□□ 0.25e-10■■■■■ 37.3
BUD13Q9BRD0 WDR55-203ENST00000506393 2477 ntTSL 214.17□□□□□ -0.145e-10■■■■■ 37.3
BUD13Q9BRD0 WDR55-201ENST00000358337 4080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.695e-10■■■■■ 37.3
BUD13Q9BRD0 WDR55-204ENST00000511232 3812 ntTSL 210.61□□□□□ -0.715e-10■■■■■ 37.3
BUD13Q9BRD0 FTL-201ENST00000331825 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.33e-44■■■■■ 37.3
BUD13Q9BRD0 TCIRG1-204ENST00000525516 708 ntTSL 222.44■■□□□ 1.182e-10■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 GALT-229ENST00000605275 678 ntTSL 320.26■□□□□ 0.832e-10■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 ANKHD1-213ENST00000462121 782 ntTSL 35.93□□□□□ -1.462e-10■■■■■ 37.1
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BUD13Q9BRD0 ZNF264-204ENST00000597447 681 ntTSL 325.06■■□□□ 1.69e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 ZNF264-203ENST00000594126 359 ntTSL 323.97■■□□□ 1.439e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.39e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 SSRP1-204ENST00000529002 648 ntTSL 523.09■■□□□ 1.299e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 TRMT2A-216ENST00000487668 1040 ntTSL 520.68■□□□□ 0.95e-9■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 TRMT2A-212ENST00000471040 848 ntTSL 319.94■□□□□ 0.782e-9■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 TRMT2A-218ENST00000492988 854 ntTSL 519.74■□□□□ 0.752e-9■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.649e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 TRMT2A-205ENST00000444256 426 ntTSL 518.19■□□□□ 0.55e-9■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 TRMT2A-206ENST00000444845 739 ntTSL 317.92■□□□□ 0.469e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 SSRP1-203ENST00000526696 948 ntTSL 316.89■□□□□ 0.299e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 ZNF264-201ENST00000263095 12163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.599e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 DAAM1-212ENST00000557327 562 ntTSL 411.24□□□□□ -0.619e-8■■■■■ 37.1
BUD13Q9BRD0 PKM-218ENST00000567087 550 ntTSL 421.28■■□□□ 12e-10■■■■■ 36.9
BUD13Q9BRD0 PKM-207ENST00000562997 582 ntTSL 411.85□□□□□ -0.512e-10■■■■■ 36.9
BUD13Q9BRD0 PKM-210ENST00000564178 554 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-10■■■■■ 36.9
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 04e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-205ENST00000540839 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.364e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-202ENST00000379312 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.374e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-223ENST00000569733 3370 ntTSL 212.41□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-201ENST00000042381 4051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RIPOR1-203ENST00000422602 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.012e-16■■■■■ 36.7
BUD13Q9BRD0 RNPEPL1-203ENST00000451363 538 ntTSL 416.98■□□□□ 0.311e-6■■■■■ 36.5
BUD13Q9BRD0 ZFX-207ENST00000459724 673 ntTSL 526.8■■□□□ 1.884e-14■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-217ENST00000448502 561 ntTSL 424■■□□□ 1.431e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-215ENST00000441728 1242 ntTSL 223.7■■□□□ 1.381e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-212ENST00000439338 873 ntTSL 523.39■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-206ENST00000416292 552 ntTSL 223.39■■□□□ 1.331e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-207ENST00000417231 984 ntTSL 523.02■■□□□ 1.281e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 36.4
BUD13Q9BRD0 UBE2F-209ENST00000433568 574 ntTSL 422.47■■□□□ 1.191e-8■■■■■ 36.4
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 4219.5 ms