Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR61

ACBD6, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD6Q9BR61 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ACBD6Q9BR61 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ACBD6Q9BR61 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ACBD6Q9BR61 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ACBD6Q9BR61 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ACBD6Q9BR61 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms