Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR11

ZSWIM1, Zinc finger SWIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM1Q9BR11 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZSWIM1Q9BR11 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZSWIM1Q9BR11 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZSWIM1Q9BR11 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZSWIM1Q9BR11 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZSWIM1Q9BR11 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZSWIM1Q9BR11 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms