Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQQ7

RTP3, Receptor-transporting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP3Q9BQQ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RTP3Q9BQQ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RTP3Q9BQQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RTP3Q9BQQ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTP3Q9BQQ7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTP3Q9BQQ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms