Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SYT3Q9BQG1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SYT3Q9BQG1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SYT3Q9BQG1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218.7 ms