Protein–RNA interactions for Protein: Q99811

PRRX2, Paired mesoderm homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX2Q99811 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRRX2Q99811 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRRX2Q99811 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRRX2Q99811 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PRRX2Q99811 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRRX2Q99811 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms