Protein–RNA interactions for Protein: Q99743

NPAS2, Neuronal PAS domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS2Q99743 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NPAS2Q99743 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NPAS2Q99743 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPAS2Q99743 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPAS2Q99743 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms