Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
COPS8Q99627 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
COPS8Q99627 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
COPS8Q99627 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
COPS8Q99627 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms