Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NAP1L3Q99457 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NAP1L3Q99457 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
NAP1L3Q99457 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NAP1L3Q99457 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NAP1L3Q99457 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms