Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CSF3RQ99062 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CSF3RQ99062 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CSF3RQ99062 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CSF3RQ99062 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms