Protein–RNA interactions for Protein: Q96SF2

CCT8L2, T-complex protein 1 subunit theta-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L2Q96SF2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8L2Q96SF2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCT8L2Q96SF2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCT8L2Q96SF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCT8L2Q96SF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCT8L2Q96SF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCT8L2Q96SF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCT8L2Q96SF2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCT8L2Q96SF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms