Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PPP1R9BQ96SB3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PPP1R9BQ96SB3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PPP1R9BQ96SB3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PPP1R9BQ96SB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PPP1R9BQ96SB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms