Protein–RNA interactions for Protein: Q96RP7

GAL3ST4, Galactose-3-O-sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST4Q96RP7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GAL3ST4Q96RP7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GAL3ST4Q96RP7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GAL3ST4Q96RP7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GAL3ST4Q96RP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms