Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSMCE2Q96MF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NSMCE2Q96MF7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
NSMCE2Q96MF7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms