Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
C9orf85Q96MD7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
C9orf85Q96MD7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
C9orf85Q96MD7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
C9orf85Q96MD7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms