Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
CCDC7Q96M83 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
CCDC7Q96M83 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
CCDC7Q96M83 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CCDC7Q96M83 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CCDC7Q96M83 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CCDC7Q96M83 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms