Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRIM47Q96LD4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRIM47Q96LD4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRIM47Q96LD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRIM47Q96LD4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRIM47Q96LD4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms