Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SGCZQ96LD1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SGCZQ96LD1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SGCZQ96LD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SGCZQ96LD1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms