Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PHACTR3Q96KR7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PHACTR3Q96KR7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PHACTR3Q96KR7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PHACTR3Q96KR7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PHACTR3Q96KR7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms