Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GJD4Q96KN9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
GJD4Q96KN9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GJD4Q96KN9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GJD4Q96KN9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
GJD4Q96KN9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
GJD4Q96KN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms