Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPTM1LQ96KA5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPTM1LQ96KA5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPTM1LQ96KA5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLPTM1LQ96KA5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLPTM1LQ96KA5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CLPTM1LQ96KA5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms