Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDK5RAP3Q96JB5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK5RAP3Q96JB5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK5RAP3Q96JB5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms