Protein–RNA interactions for Protein: Q96HV5

TMEM41A, Transmembrane protein 41A, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM41AQ96HV5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM41AQ96HV5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM41AQ96HV5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM41AQ96HV5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM41AQ96HV5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms