Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BORCS6Q96GS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BORCS6Q96GS4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
BORCS6Q96GS4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
BORCS6Q96GS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms