Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CALML4Q96GE6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
CALML4Q96GE6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CALML4Q96GE6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CALML4Q96GE6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CALML4Q96GE6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.5 ms