Protein–RNA interactions for Protein: Q96FX8

PERP, p53 apoptosis effector related to PMP-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERPQ96FX8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PERPQ96FX8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PERPQ96FX8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PERPQ96FX8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PERPQ96FX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PERPQ96FX8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms