Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
EDC3Q96F86 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
EDC3Q96F86 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
EDC3Q96F86 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
EDC3Q96F86 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
EDC3Q96F86 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
EDC3Q96F86 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms