Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC126Q96EE4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC126Q96EE4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC126Q96EE4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC126Q96EE4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC126Q96EE4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms