Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CMTM5Q96DZ9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CMTM5Q96DZ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CMTM5Q96DZ9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CMTM5Q96DZ9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms