Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
C18orf8Q96DM3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
C18orf8Q96DM3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
C18orf8Q96DM3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
C18orf8Q96DM3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
C18orf8Q96DM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms