Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB2

HDAC11, Histone deacetylase 11, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC11Q96DB2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HDAC11Q96DB2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HDAC11Q96DB2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
HDAC11Q96DB2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HDAC11Q96DB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HDAC11Q96DB2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms