Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NMD3Q96D46 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NMD3Q96D46 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NMD3Q96D46 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NMD3Q96D46 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms